生物安全柜根据生物安全防护水平的差异，可分为一级、二级、三级三种类型。一级生物安全柜只保护工作人员和环境，不保护样品。较少用。二级生物安全柜目前应用最广泛，依照入口气流风速，排气方式和循环方式可分为四个级别：A1型、A2型、B1型、B2型，所有的二级生物安全柜都可保护工作人员，环境和产品。三级生物安全柜适用于高风险的生物实验，如埃博拉，SARS等，一般用于生物防护等级为四级的实验室而设计。柜体完全气密。
生物安全柜的分类
1、一级生物安全柜
一级生物安全柜可保护工作人员和环境而不保护样品。
其气流原理和实验室通风橱基本相同，不同之处在于排气口安装有HEPA过滤器，将外排气流过滤进而防止微生物气溶胶扩散造成污染。
一级生物安全柜本身无风机，依赖外接通风管中的风机带动气流，由于不能保护柜内产品，目前较少使用。
2、二级生物安全柜
二级生物安全柜是目前应用最为广泛的柜型。
按照《中华人民共和国医药行业标准YY0569-2005生物安全柜》中的规定，二级生物安全柜依照入口气流风速、排气方式和循环方式可分为4个级别：A1型，A2型，B1型和B2型。
所有的二级生物安全柜都可提供工作人员、环境和产品的保护。
A1型：
前窗气流速度最小量或测量平均值应至少为0.38m/s。70%气体通过HEPA过滤器再循环至工作区，30%的气体通过排气口过滤排出。
A2型：
前窗气流速度最小量或测量平均值应至少为0.5m/s。70%气体通过HEPA过滤器再循环至工作区，30%的气体通过排气口过滤排出。
二级B型生物安全柜均为连接排气系统的安全柜。连接安全柜排气导管的风机连接紧急 供应电源，目的在断电下仍可保持安全柜负压，以免危险气体泄漏出实验室。其前窗气流速度最小量或测量平均值应至少为0.5m/s(100fpm)。
B1型：
70%气体通过排气口HEPA过滤器排除，30%的气体通过供气口HEPA过滤器再循环至工作区。
B2型：
100%全排型安全柜，无内部循环气流，可同时提供生物性和化学性的安全控制，可以操作挥发性化学品和挥发性核放射物作为添加剂的微生物实验。
3、三级生物安全柜
三级生物安全柜是为生物安全防护等级为4级实验室而设计的，柜体完全气密，工作人员通过连接在柜体的手套进行操作，俗称手套箱(Golvebox)，试验品通过双门的传递箱进出安全柜以确保不受污染，适用于高风险的生物试验，如进行SARS、埃博拉病毒相关实验等。
生物安全柜工作原理
主要是将柜内空气向外抽吸，使柜内保持负压状态，通过垂直气流来保护工作人员；外界空气经高效空气过滤器( high-efficiency particulate air filter, HEPA过滤器)过滤后进入安全柜内，以避免处理样品被污染；柜内的空气也需经过HEPA过滤器过滤后再排放到大气中，以保护环境。SICOLAB总结八个字“吸入、下降、循环、外排”。
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