不论是学校还是企业内部的化学实验室都建立有详尽的安全准则，虽然化学实验室存在很多危害因素，但如果采取相应的安全防护措施，实验室人员（学生）具有基本的安全常识和正确的操作方法，化学实验室会更加安全。
化学实验室常见的危害因素包括气体中毒、化学灼伤、爆炸及火灾等，除了要配置必要的个人防护用品（如防毒面具、防化服、防化手套、防护眼镜等），还要格外注意化学试剂的使用安全、电气设备的安全及人员规范化操作。
气体中毒
实验室使用的化学药品几乎都有一定的毒性。而真正实验室安全防护的重点首先是防毒，需要强调的是慢性毒害，因为急性的毒害是很容易引起觉并加以避免的，比如误食氰化钾，吸入氯气等。为避免有毒气体进入呼吸道，可以选择防毒面具做好呼吸防护。
中毒的症状很难察觉，多数为失眠、易怒、记忆力减退、情绪失常等，通常会未老先衰，早逝。在进行实验之前，一定要首先查阅有关文献，了解所用试剂的毒性，采取相应的防毒措施。
通常有毒化学品对人体的毒害途径包括：
(1)吸入。吸入是最常见的吸毒方式。有毒物质可以以气体、蒸气、粉尘、烟雾的形式被吸入。在使用挥发性试剂时，要在通风橱内进行。蒸馏或回流时冷凝管要有效。用嗅法鉴别化学物质时必须十分小心。化学实验产生有毒有害气体可以选择3M防毒面具或者防毒口罩预防中毒。
(2)体表吸收。有毒物质可以以气体、液体的形式被皮肤吸收。接触有毒物质时要戴上防化手套，如果防化手套有破洞，要及时更换。为防止化学品溶剂飞溅，可以穿戴防化服。如果有毒物质接触皮肤，应立即用大量水冲洗，然后用肥皂水清洗。
化学灼伤
强酸、强碱和某些强腐蚀性物质与水或其他化学物质发生剧烈反应，酸类多数会产生烟雾具有强烈的腐蚀性，吸入烟雾、粉尘会对人体造成严重伤害。使用强酸强碱要在通风橱内操作，并采取必要的防护措施，比如防化服、防化手套，尤其要注意保护眼睛。
其中氢氟酸与氟化氢对玻璃有强烈腐蚀作用，使用时一定要戴上新的防化手套，如果溅到皮肤上，要立刻就医。稀释浓硫酸时不能向浓硫酸中加水，正确的方法是在快速搅拌下缓慢向冷水中加入浓硫酸，防止溅出。
化学实验室作业若化学品不慎飞溅到皮肤上，立即用大量水冲洗。强酸强碱进入眼睛，冲水后要立刻就医。强酸强碱撒落台面、地面，不可以用水冲洗，要迅速戴上防化手套，用湿抹布反复擦洗。使用大量发烟酸或处理泄漏时，要戴防毒面具和穿防护服。
爆炸
化学实验室，尤其是有机化学实验室常用的多是一些易燃、易爆的物质或其混合物，使用这些物质时，最重要的就是要注意不能有大量易燃、易爆物质、压力和热的积累和突然释放。在实验中，可采取以下措施进行防备：
(1)尽量选用较为安全的试剂。
(2)使用爆炸性物质，单次用量要尽可能少，同时要有防备。
(3)易燃、易爆物品周围不能有可燃物质。易爆物品要注意防止突然震动和过热。
(4)有爆炸和着火危险的反应，要先进行多次小规模实验，然后逐步放大。
(5)对于放热反应，添加反应物要逐步进行，少量多次。
(6)有机溶剂的蒸馏和回流要避免过热和暴沸现象的发生。
火灾
火灾往往是一些可燃物质与氧或氧化剂化合反应燃烧所致。实验中使用及实验过程中产生的化学物质有许多是具有可燃性的，这些物质遇到火源很可能会燃烧引发火灾。由于大量使用可挥发性的可燃物质，尤其是有机溶剂，火灾是有机化学实验室相当常见的事故之一。
有机溶剂通常挥发性比较强，挥发出来的蒸气可以迁移到较远的地方，如果接触火种，顺着蒸气燃烧，会导致液体着火。有可燃有机溶剂的操作必须在通风橱内进行，要避免有机溶剂蒸气在实验室聚集。实验室内不能存放大量有机溶剂，要有专门通风良好的储藏室。
使用过金属钠的容器要用异丙醇或乙醇处理2小时以上，然后倒入大量水中，不能向瓶内加水，最后用水冲洗干净。金属钠着火，不能使用二氧化碳或四氯化碳灭火器，要使用砂或者干粉灭火器。
